Главная цель в игре The Inner Sea Build – не дать инопланетным тварям пробить все эшелоны обороны космической базы землян. Для этого вам вверяется 4 вида защитных башен: стандартная лазерная башня (Laser), башня поражающая целую группу войск (Bomb), башня замедляющая войска противника (Slow) и башня наносящая большой урон (Beam). По ходу прохождения игры игроку откроется еще два вида оборонительных сооружения: башня стреляющая напалмом (Ion) и башня поражающая врагов на большом расстоянии (Sniper).
Чтобы дополнительно разнообразить игру, разработчики ввели в The Inner Sea Build такой элемент как дроиды. Они могут чинить поврежденные башни и собирать ресурсы для постройки новых башен и модернизации уже существующих